More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1932 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
682 aa  1375    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.6 
 
 
652 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  49.21 
 
 
656 aa  330  7e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  47.45 
 
 
708 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  52.23 
 
 
563 aa  320  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 
563 aa  318  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  44.95 
 
 
656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
713 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 
563 aa  293  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
650 aa  291  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 
726 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  45.61 
 
 
566 aa  271  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
625 aa  250  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
633 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
627 aa  244  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
536 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
621 aa  238  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  28.4 
 
 
674 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0030  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
660 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.136855  normal  0.0162002 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 
530 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  30.21 
 
 
770 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 
737 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 
650 aa  204  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.19 
 
 
963 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.81 
 
 
651 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.81 
 
 
651 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.81 
 
 
651 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.81 
 
 
651 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4466  methyl-accepting chemotaxis protein  27.43 
 
 
651 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3758  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 
651 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 
651 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 
651 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000238421 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  39.62 
 
 
626 aa  192  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 
772 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.5 
 
 
773 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 
963 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 
773 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.86 
 
 
1029 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.31 
 
 
782 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 
380 aa  158  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 
819 aa  157  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  29.43 
 
 
1100 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  37.73 
 
 
661 aa  152  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 
660 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 
547 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 
620 aa  144  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 
668 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 
543 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  31.21 
 
 
660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 
542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  29.22 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 
658 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 
564 aa  142  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.52 
 
 
648 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
620 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.62 
 
 
660 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
569 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 
655 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 
530 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  36.33 
 
 
553 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.63 
 
 
622 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
372 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  32.01 
 
 
660 aa  138  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  30.87 
 
 
660 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  32 
 
 
650 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
636 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  29.74 
 
 
646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  29.28 
 
 
658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  30.48 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.41 
 
 
695 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  29.53 
 
 
658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  26.53 
 
 
643 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 
660 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0331  methyl-accepting chemotaxis protein  31.22 
 
 
578 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 
660 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 
660 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 
660 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 
660 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.51 
 
 
622 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 
522 aa  135  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  29.28 
 
 
658 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  29.28 
 
 
658 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 
658 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  29.28 
 
 
658 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 
646 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.09 
 
 
637 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 
660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1223  methyl-accepting chemotaxis protein  34.01 
 
 
381 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  26.42 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  26.69 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 
660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  29.79 
 
 
623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  29.35 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  31.08 
 
 
650 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  31.08 
 
 
660 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  31.08 
 
 
650 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>