39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1841 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  100 
 
 
313 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  38.31 
 
 
304 aa  216  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  34.85 
 
 
304 aa  195  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  36.58 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  32.42 
 
 
277 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  36 
 
 
307 aa  107  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  35.12 
 
 
292 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  32.06 
 
 
273 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  34.63 
 
 
292 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  30.89 
 
 
261 aa  99.4  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  30.7 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  28.28 
 
 
464 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  28.51 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  28.79 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.09 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  25.68 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  27.56 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  24.54 
 
 
474 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  24.44 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  22.54 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  26.36 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  23.33 
 
 
469 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  28.57 
 
 
469 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  23.22 
 
 
470 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  26.05 
 
 
463 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  23.97 
 
 
458 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  22.77 
 
 
471 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  21 
 
 
456 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  27.57 
 
 
464 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  22.75 
 
 
457 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  23.08 
 
 
456 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  25.39 
 
 
454 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  27.3 
 
 
462 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  21.84 
 
 
478 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  23.57 
 
 
461 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  19.64 
 
 
509 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  23.5 
 
 
472 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  23.81 
 
 
480 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  24.17 
 
 
473 aa  43.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>