More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1839 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  100 
 
 
657 aa  1337    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  36.89 
 
 
324 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  36.7 
 
 
329 aa  206  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  36.12 
 
 
338 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  38.51 
 
 
320 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.26 
 
 
328 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  38.68 
 
 
305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  34.33 
 
 
327 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  37.58 
 
 
416 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  35.21 
 
 
323 aa  186  9e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  36.42 
 
 
417 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  36.97 
 
 
311 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  35.9 
 
 
415 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0842  type II restriction enzyme HpaII (endonuclease HpaII)  32.9 
 
 
368 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.90153e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  36.56 
 
 
319 aa  176  9e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  35.22 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  32.19 
 
 
428 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  33.03 
 
 
318 aa  170  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
406 aa  167  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
727 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.53 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  48.45 
 
 
424 aa  164  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  35.41 
 
 
425 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  36.15 
 
 
417 aa  160  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  35.01 
 
 
491 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 
487 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  32.87 
 
 
426 aa  158  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  44.33 
 
 
436 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  35.8 
 
 
320 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  44.55 
 
 
417 aa  157  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  46.24 
 
 
419 aa  157  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 
336 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  39.62 
 
 
438 aa  156  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  45.56 
 
 
331 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  42.47 
 
 
467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.88 
 
 
350 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  45.05 
 
 
417 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 
350 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  34.13 
 
 
474 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  33.42 
 
 
476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  33.42 
 
 
476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  33.42 
 
 
476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  33.42 
 
 
476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  33.42 
 
 
476 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.57 
 
 
451 aa  144  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  41.41 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  33.43 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  43.98 
 
 
460 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  43.98 
 
 
460 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  32.87 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
472 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  32.33 
 
 
471 aa  137  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  32.87 
 
 
472 aa  137  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
334 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  32.6 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  40.72 
 
 
456 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  40.72 
 
 
456 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  40.62 
 
 
373 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 
329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
368 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
328 aa  127  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 
350 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  28.27 
 
 
495 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
423 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.7 
 
 
345 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
379 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
427 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0101  Type II site-specific deoxyribonuclease  29.77 
 
 
336 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  39.33 
 
 
413 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.13 
 
 
313 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.29 
 
 
313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  26.62 
 
 
315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
359 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  35.43 
 
 
483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
335 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  26.4 
 
 
318 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
323 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 
335 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  32.68 
 
 
352 aa  107  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
308 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
632 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 
313 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 
386 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
444 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
385 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
385 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  36.61 
 
 
348 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 
438 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
418 aa  97.8  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
310 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  32.51 
 
 
383 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
662 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
652 aa  94  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  31.58 
 
 
423 aa  93.6  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
380 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>