More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1799 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  100 
 
 
214 aa  433  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  58.22 
 
 
214 aa  257  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1259  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  58.6 
 
 
215 aa  252  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0312879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1440  ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 
214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0838  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  53.05 
 
 
214 aa  245  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19069  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1092  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 
211 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0408  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1314  ABC transporter, ATP-binding protein  52.2 
 
 
211 aa  211  9e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1195  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 
211 aa  206  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.762072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0549  ABC transporter, ATP-binding protein  50.73 
 
 
211 aa  204  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.977002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  40 
 
 
231 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 
224 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  40.28 
 
 
236 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.62 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.19 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.81 
 
 
233 aa  161  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.19 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.72 
 
 
232 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.19 
 
 
232 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  43.62 
 
 
242 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.25 
 
 
232 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.88 
 
 
201 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.27 
 
 
236 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  38.6 
 
 
227 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.6 
 
 
227 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  37.85 
 
 
237 aa  158  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  39.72 
 
 
232 aa  158  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
275 aa  157  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  39.02 
 
 
255 aa  157  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3686  ABC transporter related  38.66 
 
 
202 aa  157  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  39.71 
 
 
653 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  37.13 
 
 
239 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  38.05 
 
 
235 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.2 
 
 
225 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
231 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.19 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 
228 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.78 
 
 
238 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  37.13 
 
 
239 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  39.8 
 
 
243 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 
231 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 
253 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 
253 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  39.81 
 
 
226 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.45 
 
 
247 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3052  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
242 aa  155  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
253 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
225 aa  155  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
235 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
242 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  38.78 
 
 
235 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.04 
 
 
236 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.68 
 
 
252 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.73 
 
 
237 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.73 
 
 
231 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.2 
 
 
225 aa  154  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
227 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.79 
 
 
238 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.36 
 
 
226 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  38.32 
 
 
227 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  38.5 
 
 
228 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  38.03 
 
 
227 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  38.69 
 
 
230 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.88 
 
 
238 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.51 
 
 
247 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.94 
 
 
249 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  38.36 
 
 
232 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
249 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.27 
 
 
235 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.94 
 
 
249 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.25 
 
 
230 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  35.98 
 
 
230 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  38.89 
 
 
230 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  38.5 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  35.51 
 
 
247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  39.81 
 
 
261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.1 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.88 
 
 
234 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.67 
 
 
225 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.27 
 
 
228 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  38.31 
 
 
230 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.63 
 
 
249 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.16 
 
 
258 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>