131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1750 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  35.24 
 
 
234 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.48 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  36.77 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  35.44 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  34.02 
 
 
219 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  37.86 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  35.06 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  35.71 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  35.06 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  35.06 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  35.06 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  36.36 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  35.71 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  35.71 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  34.35 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  45.26 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  33.77 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  32.24 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  30.32 
 
 
230 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  33.92 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  29.63 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  34.06 
 
 
280 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  27.57 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  27.1 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  27.1 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  33.53 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  31.09 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.04 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  27.1 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  38.33 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  30.88 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.24 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  34.78 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  32.21 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  30.38 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  30.36 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  25.88 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  29.13 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  36.67 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  36.73 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  26.03 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  29 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  34.4 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  38.61 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  40.66 
 
 
257 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  25.53 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  36.89 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  31.09 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  28.14 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  27.56 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  25.43 
 
 
242 aa  62.4  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  23.92 
 
 
234 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  26.25 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  26.25 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  25.1 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  36.23 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.39 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  25.83 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  26.79 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  37.76 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  26.25 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  39.18 
 
 
279 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  25.62 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  28.02 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  25.62 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  27.17 
 
 
244 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  34.13 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  32.71 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  25.21 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  31.71 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  33.59 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  30.56 
 
 
267 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  26.56 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  31.13 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  45.35 
 
 
287 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  33.03 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  37.4 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  37.78 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  28.43 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  37.5 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  27.98 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  31.65 
 
 
265 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  31.39 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  34.45 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  36.36 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2540  hypothetical protein  24.53 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386612  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  26.61 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  31.54 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  30.08 
 
 
332 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  26.61 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  26.61 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  31.63 
 
 
269 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  31.18 
 
 
271 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  31.18 
 
 
271 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  26.15 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>