42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1716 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1716  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 929 aa  1696    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.852019  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1726  hemolysin-type calcium-binding region  41.99 
 
 		 1144 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.57086  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3840  hemolysin-type calcium-binding region  37.8 
 
 		 1093 aa  148  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0668693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1083 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  30.28 
 
 		 939 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  29.09 
 
 		 941 aa  62  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  37.36 
 
 		 2178 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  32.23 
 
 		 921 aa  53.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.77 
 
 		 3209 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  29.94 
 
 		 1883 aa  51.6  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  44.74 
 
 		 476 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  32.35 
 
 		 221 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  53.7 
 
 		 1055 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  40 
 
 		 1610 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52.08 
 
 		 4106 aa  48.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  36.04 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  30.92 
 
 		 3184 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 518 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  27.91 
 
 		 786 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  36.04 
 
 		 480 aa  47  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  45.16 
 
 		 1895 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  50 
 
 		 1346 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  26.53 
 
 		 517 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 		 1855 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  27.91 
 
 		 817 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.76 
 
 		 2678 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  55.1 
 
 		 4285 aa  46.2  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0533  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 359 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.695548  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  42.11 
 
 		 474 aa  46.2  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  47.83 
 
 		 621 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.34 
 
 		 727 aa  45.8  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  32.64 
 
 		 479 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 2507 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.19 
 
 		 1839 aa  45.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  45.33 
 
 		 475 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.64 
 
 		 4334 aa  44.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  35.35 
 
 		 539 aa  44.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  30.61 
 
 		 385 aa  44.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  50 
 
 		 5094 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 2346 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.33 
 
 		 1610 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  35.44 
 
 		 4848 aa  44.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>