More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1653 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
372 aa  738    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  34.8 
 
 
654 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 
655 aa  149  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 
655 aa  149  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  62.5 
 
 
708 aa  143  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 
649 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  35.47 
 
 
664 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
650 aa  142  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  36.19 
 
 
553 aa  142  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  54.92 
 
 
713 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  49.32 
 
 
563 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  36.19 
 
 
663 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 
625 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  53.46 
 
 
627 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
659 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
651 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
682 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
659 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
662 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
653 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.2 
 
 
652 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
665 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  34.34 
 
 
540 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  63.03 
 
 
621 aa  136  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
656 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  47.02 
 
 
626 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  32.84 
 
 
544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  32.84 
 
 
596 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 
546 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.35 
 
 
563 aa  133  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  33.33 
 
 
678 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  56.03 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  55.28 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  31.18 
 
 
658 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  31.4 
 
 
700 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  56.76 
 
 
650 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  32.5 
 
 
656 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  29.8 
 
 
694 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  65.66 
 
 
536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  32.5 
 
 
660 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  33.58 
 
 
653 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  56 
 
 
633 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  50 
 
 
656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  32.97 
 
 
657 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  34.77 
 
 
651 aa  127  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  31.4 
 
 
700 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  35.42 
 
 
657 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  35.42 
 
 
545 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  35.42 
 
 
652 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  31.4 
 
 
700 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  50.77 
 
 
533 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  53.6 
 
 
661 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.39 
 
 
530 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  63.64 
 
 
654 aa  123  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  35.69 
 
 
656 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  42.29 
 
 
236 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  35.08 
 
 
731 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.94 
 
 
658 aa  120  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  51.67 
 
 
666 aa  119  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 
635 aa  116  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  54.46 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  38.6 
 
 
604 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  35.29 
 
 
459 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
632 aa  113  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
663 aa  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  32.57 
 
 
584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0322  methyl-accepting chemotaxis protein  47.86 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  36.57 
 
 
458 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  32.18 
 
 
593 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  34.56 
 
 
459 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 
553 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000172296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  40.68 
 
 
459 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.1 
 
 
540 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  37.08 
 
 
578 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  44.67 
 
 
360 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
429 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
429 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
429 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.34 
 
 
720 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.9 
 
 
720 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3929  methyl-accepting chemotaxis protein  36.56 
 
 
505 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
675 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
675 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
675 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
546 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  53.33 
 
 
431 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
544 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  44.72 
 
 
600 aa  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  59.14 
 
 
306 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  39.77 
 
 
643 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.43 
 
 
530 aa  103  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  39.18 
 
 
421 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
675 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  42.14 
 
 
561 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  30.57 
 
 
771 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 
570 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 
590 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
626 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  52.07 
 
 
365 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>