More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1579 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
175 aa  359  9e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  68.79 
 
 
175 aa  256  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  54.75 
 
 
182 aa  197  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  56.65 
 
 
169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  52.51 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  51.96 
 
 
182 aa  195  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  53.76 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  51.4 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  52.57 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  52.57 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  52.6 
 
 
177 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  52.02 
 
 
179 aa  183  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  50.87 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  50.29 
 
 
186 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  47.7 
 
 
175 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  47.7 
 
 
175 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  47.13 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  51.45 
 
 
173 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  49.41 
 
 
187 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  49.41 
 
 
187 aa  174  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  47.7 
 
 
183 aa  174  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  47.09 
 
 
181 aa  174  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  49.42 
 
 
175 aa  171  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  48.55 
 
 
184 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  48.55 
 
 
184 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  49.71 
 
 
175 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  48.55 
 
 
184 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  48.55 
 
 
184 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  48.55 
 
 
256 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  48.55 
 
 
184 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  48.55 
 
 
256 aa  168  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  48.55 
 
 
293 aa  168  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  46.86 
 
 
167 aa  168  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1343  ferripyochelin binding protein (fbp)  50 
 
 
176 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000136354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  47.98 
 
 
184 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  47.19 
 
 
174 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  47.43 
 
 
174 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  45.71 
 
 
167 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  48.28 
 
 
175 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  45.09 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  44.83 
 
 
183 aa  164  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  48.55 
 
 
174 aa  164  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  48.84 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  45.09 
 
 
182 aa  164  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  46.63 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  46.07 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  48.26 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  47.93 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  47.7 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  45.14 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  47.4 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  45.71 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  45.93 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  49.11 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  47.09 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  48.21 
 
 
179 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
176 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  44 
 
 
168 aa  161  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  45.4 
 
 
170 aa  160  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  45.4 
 
 
170 aa  160  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  45.4 
 
 
170 aa  160  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  45.4 
 
 
170 aa  160  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  45.66 
 
 
174 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  44.25 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  44.83 
 
 
170 aa  160  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  44.25 
 
 
170 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  42.86 
 
 
171 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  44.51 
 
 
173 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  48.52 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  47.93 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  48.52 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  45.4 
 
 
189 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  44.83 
 
 
194 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  48.52 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  47.17 
 
 
154 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  47.09 
 
 
182 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.86 
 
 
175 aa  158  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  44.25 
 
 
170 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  44.25 
 
 
170 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  43.1 
 
 
174 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  45.09 
 
 
174 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  43.1 
 
 
174 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 
174 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  43.68 
 
 
174 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  42.29 
 
 
175 aa  158  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  45.35 
 
 
178 aa  158  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  46.15 
 
 
170 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  46.82 
 
 
174 aa  158  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  44.25 
 
 
174 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  48.52 
 
 
181 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  44.25 
 
 
170 aa  157  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  46.75 
 
 
183 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  45.4 
 
 
172 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  47.34 
 
 
181 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  45.14 
 
 
174 aa  157  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  44.77 
 
 
182 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  44.77 
 
 
182 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.89 
 
 
181 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  44.83 
 
 
170 aa  156  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  42.53 
 
 
174 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>