More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1575 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  64.23 
 
 		 526 aa  661    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  63.39 
 
 		 510 aa  640    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  62.24 
 
 		 521 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 521 aa  1039    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  62.16 
 
 		 522 aa  645    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  62.31 
 
 		 529 aa  652    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  58.85 
 
 		 526 aa  615  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  60 
 
 		 526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  60 
 
 		 526 aa  601  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  59.42 
 
 		 526 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 		 533 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  40.68 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  41.05 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.24 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 533 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.77 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.73 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  41.57 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.11 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.35 
 
 		 532 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  40.73 
 
 		 535 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.47 
 
 		 532 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  41.23 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  41.02 
 
 		 525 aa  359  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.68 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.68 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 		 533 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.76 
 
 		 853 aa  350  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  37.77 
 
 		 632 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 		 554 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  39.74 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 		 632 aa  347  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.79 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41.27 
 
 		 533 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.64 
 
 		 856 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.04 
 
 		 533 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  40.13 
 
 		 554 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 632 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  38.75 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39.92 
 
 		 534 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.61 
 
 		 535 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.76 
 
 		 533 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.41 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  38.41 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40.43 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.28 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.54 
 
 		 533 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 640 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  36.81 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.16 
 
 		 512 aa  325  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.76 
 
 		 839 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  37.6 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.17 
 
 		 532 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.35 
 
 		 844 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  38.91 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.79 
 
 		 856 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  37.13 
 
 		 595 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.84 
 
 		 614 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  37.89 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.71 
 
 		 537 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  36.47 
 
 		 633 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.71 
 
 		 848 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.76 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  36.49 
 
 		 636 aa  314  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  39.38 
 
 		 535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  39.04 
 
 		 616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  0.000000727457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  35.45 
 
 		 621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  38.65 
 
 		 616 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  38.65 
 
 		 616 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2482  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 		 616 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000187651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.21 
 
 		 844 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1572  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 616 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000232578  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  36.22 
 
 		 531 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.29 
 
 		 849 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.38 
 
 		 845 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 616 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 616 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 616 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000488716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  36.23 
 
 		 534 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  37.25 
 
 		 621 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1472  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 		 610 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.19 
 
 		 844 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  37.14 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3111  preprotein translocase subunit SecD  37.07 
 
 		 616 aa  307  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 843 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  35.85 
 
 		 534 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  37.25 
 
 		 626 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1403  preprotein translocase subunit SecD  37.55 
 
 		 616 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  37.38 
 
 		 609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.4 
 
 		 834 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 		 615 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  36.51 
 
 		 621 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  37.82 
 
 		 614 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  36.4 
 
 		 604 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  36.82 
 
 		 532 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  36.82 
 
 		 532 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  36.31 
 
 		 616 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>