More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1565 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 328 aa  669    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  61.44 
 
 		 305 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  57.8 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  55.79 
 
 		 417 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  53.16 
 
 		 323 aa  308  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  50.62 
 
 		 425 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  50.15 
 
 		 406 aa  282  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  48.82 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  50.45 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  47.22 
 
 		 424 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  46.22 
 
 		 419 aa  271  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  44.7 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.61 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  43.22 
 
 		 426 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  46.63 
 
 		 487 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  42.98 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  46.82 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  45.76 
 
 		 417 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  46.65 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  48.01 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  45.51 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  46.03 
 
 		 338 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  44.86 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  44.47 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  43.78 
 
 		 491 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  43.75 
 
 		 447 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  43.94 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  41.94 
 
 		 471 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  42.98 
 
 		 472 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  42.7 
 
 		 472 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  42.7 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  41.56 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  42.7 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  42.7 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  42.7 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  41.57 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  42.42 
 
 		 472 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  39.64 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  40.32 
 
 		 373 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  41.69 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  41 
 
 		 417 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  41.85 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  41.85 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  41.85 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  41.85 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  41.85 
 
 		 476 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  38.71 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 		 727 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  41.09 
 
 		 350 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  42.58 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  43.37 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  39.26 
 
 		 657 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  36.9 
 
 		 352 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  45.02 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  53.37 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.82 
 
 		 451 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  35.43 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.44 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  33.43 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.35 
 
 		 423 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 		 423 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  45.54 
 
 		 460 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  45.54 
 
 		 460 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  34 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.02 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  42 
 
 		 456 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  42 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.51 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  34.6 
 
 		 444 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.33 
 
 		 328 aa  149  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.23 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  32.8 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  29.34 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.68 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  39.3 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  42.22 
 
 		 406 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  42.86 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  32.59 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  33.13 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  34.02 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  34.25 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.19 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.82 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  37.81 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.9 
 
 		 357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  42.26 
 
 		 483 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 		 490 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  32.19 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0056  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  67.82 
 
 		 88 aa  122  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.24 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  25.34 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.84 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.8 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.39 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>