More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1458 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  54.13 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  53.18 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  37.96 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  37.56 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  34.56 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  38.6 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  38.18 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  37.33 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  33.18 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2786  response regulator  32.23 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  33.8 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  33.49 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.45 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  29.95 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  30.45 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.46 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4098  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  30.59 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  33.03 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  28.77 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.31 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  28.77 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.84 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.56 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  29.22 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  29.17 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.08 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  33.48 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  28.51 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 223 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 250 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  29.09 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  29.09 
 
 		 287 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  29.09 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  29.09 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  29.09 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  29.09 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  29.09 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  30.23 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  29.68 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  28.96 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  28.05 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.19 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  29.22 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  29.44 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.33 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.33 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.33 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.39 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  30.45 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  25.22 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>