145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1433 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1433  peptidase M52, hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  50.56 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  49.11 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  49.12 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  47.78 
 
 		 192 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  47.22 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  47.22 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  47.22 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  44.44 
 
 		 180 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  47.75 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  46.67 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  48.33 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  45.86 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  44.32 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  47.22 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  47.22 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  43.75 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  46.67 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  46.67 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  46.67 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  43.75 
 
 		 178 aa  167  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  50 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  43.75 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  39.44 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.65 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  35.37 
 
 		 161 aa  91.3  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  30.06 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  36.17 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  34.43 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  29.7 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  34.96 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  35.25 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  35.34 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  30.68 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  31.75 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  27.06 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  34.96 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  32.52 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  34.07 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  29.7 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  30.08 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  34.68 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  33.62 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.29 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.05 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.05 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  32.26 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.05 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  27.95 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.05 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.05 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  32.59 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  34.68 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  32.59 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.54 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.54 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  28.82 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  31.45 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.54 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  31.15 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.97 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  32.8 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  30.18 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  27.16 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  32.14 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.88 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  34.21 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  29.45 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.71 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  32.17 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  26.77 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  26.77 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  26.77 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.2 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  27.82 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  27.2 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  26.06 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.56 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  31.71 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  31.3 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  31.58 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  25.43 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  26.74 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>