More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1416 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  202  9e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  70.59 
 
 
102 aa  146  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 
102 aa  140  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 
102 aa  139  1e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
104 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  63.37 
 
 
104 aa  131  2e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 
102 aa  128  2e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 
102 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  62.75 
 
 
102 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
102 aa  126  8e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
104 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
124 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  45 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
105 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  46.08 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 
103 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
102 aa  93.6  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
142 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  47 
 
 
188 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  45.63 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  9.15025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  45.63 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.08 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
104 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.83134e-08  unclonable  1.78409e-08 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.2148e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
115 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.96723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  87  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.76317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  46 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  1.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.60043e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.80512e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  2.43272e-05  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.56676e-07  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.6 
 
 
221 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.28168e-06  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  7.66256e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.25607e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.16305e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.11872e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>