More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1414 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  100 
 
 		 369 aa  755    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.38 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  57.97 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  55.92 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  55.14 
 
 		 376 aa  348  8e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  63.86 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  59.22 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  59.22 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  58.9 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.08 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.6 
 
 		 340 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.67 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  45.2 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  50.87 
 
 		 333 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.84 
 
 		 338 aa  259  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  43.35 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  43.35 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  42.54 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  47.04 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.15 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  49.13 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.85 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  42.78 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  48.5 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  45.66 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  48.59 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  43.89 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.66 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  45.21 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  42.69 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  46.58 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  42.69 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.54 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  42.42 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  43.2 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.76 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  49.66 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.04 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  42.09 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  44.19 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  45.31 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  46.55 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  49.13 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  46.9 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.76 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  46.56 
 
 		 338 aa  243  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.76 
 
 		 415 aa  242  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  50.35 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  46.55 
 
 		 407 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  50.7 
 
 		 351 aa  242  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  44.9 
 
 		 334 aa  242  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  46.21 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  48.44 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.48 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  43.6 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  45.33 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  48.1 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  44.61 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  48.77 
 
 		 354 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.41 
 
 		 425 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  42.77 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  42.78 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  47.75 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  44.31 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  52.44 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  48.42 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  46.56 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.51 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  47.52 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  43.98 
 
 		 454 aa  239  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.74 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  47.19 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  49.3 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  47.2 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.26 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  46.83 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  48.62 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.85 
 
 		 369 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  47.59 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  46.85 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  44.01 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.42 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.08 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  47.08 
 
 		 428 aa  235  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  44.74 
 
 		 366 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.21 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  47.59 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.51 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.87 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  44 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  44 
 
 		 339 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  49.65 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  44.83 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>