214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1398 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  100 
 
 		 417 aa  845    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0520  TolB domain protein  45.37 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  45.84 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  44.68 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  45.26 
 
 		 402 aa  359  4e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0922  translocation protein TolB  43.97 
 
 		 418 aa  360  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.484523  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  44.79 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  44.79 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  41.27 
 
 		 417 aa  342  8e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  41.53 
 
 		 399 aa  333  5e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  25.69 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  25.3 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.34 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  24.6 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  24.6 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  24.6 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.91 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  22.13 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  23.41 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.41 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  22.13 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  24.11 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  24.21 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  23.41 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  23.32 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.54 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.54 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  24.89 
 
 		 438 aa  89.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  23.06 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.47 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  22.51 
 
 		 445 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  22.62 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  22.19 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  24.45 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  24.45 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  22.13 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  24.45 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  24.09 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  24.34 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  23.28 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  24.57 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  23.71 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  23.81 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.84 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  24.09 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  22.84 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  23.23 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  20.91 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.69 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  22.84 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  22.84 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  23.14 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  24.92 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  21.99 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  22.72 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.99 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  22.57 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  21.61 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  20.25 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  22.71 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  23.65 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  24.57 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  21.75 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  22.73 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  22.89 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  21.97 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  22.27 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  22.08 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  21.97 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.56 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  22.77 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  22.5 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  19.56 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  22.48 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.55 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  22.48 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  19.88 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.32 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  22.44 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  21.22 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  20.06 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  19.83 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  22.41 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  19.74 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  23.78 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  20.55 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  21.55 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  21.62 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  19.74 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  24.66 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  21.55 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>