More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1397 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0923  Omp18  55.37 
 
 
168 aa  193  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1519  Omp18  49.17 
 
 
173 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594482  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1744  Omp18  52.5 
 
 
168 aa  169  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00216303  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0521  OmpA/MotB domain protein  44.63 
 
 
166 aa  166  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0693  Omp18  46.86 
 
 
154 aa  162  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0174267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0108  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  44.25 
 
 
165 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0148  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  44.25 
 
 
165 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125516  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0120  peptidoglycan-associated lipoprotein Omp18  43.68 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000178354  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0201  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  43.1 
 
 
161 aa  143  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000039239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  35.03 
 
 
193 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.52 
 
 
188 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  48.08 
 
 
165 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.16 
 
 
199 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  39.29 
 
 
194 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  32.04 
 
 
194 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.5 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.45 
 
 
241 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.27 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  43.27 
 
 
178 aa  99  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.17 
 
 
170 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.74 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.55 
 
 
163 aa  97.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.73 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3337  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.76 
 
 
242 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  32.73 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.48 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.37 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  41.41 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.07 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  34.9 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0071  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  58.33 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0072  peptidoglycan-associated lipoprotein  58.33 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.524746  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.35 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.31 
 
 
169 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.31 
 
 
169 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.31 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  34.27 
 
 
177 aa  94  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  41.35 
 
 
169 aa  94  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.73 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  40.57 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 
155 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3418  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
242 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.38 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3482  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
242 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.784899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  40.38 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  36.84 
 
 
173 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  40.38 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  38.46 
 
 
148 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.29 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3118  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.16 
 
 
172 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.396871  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.42 
 
 
169 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
169 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  34.64 
 
 
180 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  32.95 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
167 aa  92  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.64 
 
 
180 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.38 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.42 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.5 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  41.51 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.31 
 
 
170 aa  91.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  40.38 
 
 
172 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.38 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  39.42 
 
 
170 aa  90.9  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.59 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  35.63 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  34.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  43.27 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.02 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
165 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.95 
 
 
183 aa  89  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.39 
 
 
176 aa  89  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.82 
 
 
185 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.04 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  37.04 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.42 
 
 
177 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.96 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  39.39 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  32.37 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.95 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  31.36 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  34.91 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  37.04 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  32.69 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>