More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1366 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  100 
 
 		 371 aa  742    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  38.93 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  39.44 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 396 aa  189  9e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  40.17 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  40.59 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  31.52 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  33.55 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  29.15 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  28.84 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  35.11 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  36.56 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  34.91 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  33.8 
 
 		 256 aa  116  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  28.21 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  30.55 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  34.33 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  25.69 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  25.69 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  30.85 
 
 		 497 aa  105  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  34.45 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 310 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 600 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  26.1 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  30.86 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  27.38 
 
 		 336 aa  99.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  30.49 
 
 		 571 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  30.49 
 
 		 571 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  24.88 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 500 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 607 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 482 aa  96.7  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.52 
 
 		 584 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 624 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.27 
 
 		 565 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  23.96 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 582 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 466 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 489 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  22.12 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  27.54 
 
 		 501 aa  93.6  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  31.82 
 
 		 629 aa  92.8  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 597 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  30.41 
 
 		 537 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  24.42 
 
 		 422 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  23.27 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.36 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  24.41 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  26.42 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  26.39 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.61 
 
 		 468 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  30.05 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 602 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  27.05 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 597 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 462 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 475 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 867 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.82 
 
 		 469 aa  90.1  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1172  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 580 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0874083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  26.03 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  25.7 
 
 		 468 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 608 aa  89.4  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 592 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1217  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1274  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1039  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  24.4 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1016  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.853387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1017  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.7 
 
 		 587 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 609 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1118  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 585 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1197  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 580 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.970095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 554 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>