More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1362 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  100 
 
 		 381 aa  763    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  30.74 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  30.98 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  28.17 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 397 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  27.81 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  29.76 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  29.21 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  24.55 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.87 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  26.18 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 		 368 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  23.78 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  23.78 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  22.04 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  23.48 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  23.51 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  23.51 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  23.51 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  23.51 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  22.04 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  24.54 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  23.02 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  23.57 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.85 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  23.57 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 1462 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  21.78 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  23.57 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  23.24 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  24.68 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.33 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  27.95 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  22.41 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  22.41 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  23.33 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  27.36 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  23.68 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  25.33 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  22.57 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.95 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  24.25 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  22.65 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  21.89 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  22.92 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  21.02 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  21.59 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  21.05 
 
 		 338 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  21.58 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  21.99 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  21.59 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  21.99 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  23.27 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  26.41 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  24.76 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  26.87 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  26 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  25.65 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>