77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1349 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1349  NnrS  100 
 
 
416 aa  833  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  1.46845e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1555  NnrS family protein  49.88 
 
 
410 aa  406  1e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  1.08211e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  25.9 
 
 
402 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1808  NnrS family protein  27.31 
 
 
434 aa  93.2  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2680  NnrS family protein  29.85 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  24.88 
 
 
432 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  23.23 
 
 
414 aa  84.7  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  23.45 
 
 
413 aa  81.3  3e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  23.45 
 
 
413 aa  80.9  4e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  27.54 
 
 
393 aa  80.1  7e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  25.71 
 
 
403 aa  79.3  1e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  36.97 
 
 
389 aa  77  6e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  24.87 
 
 
393 aa  76.6  7e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  26.79 
 
 
401 aa  75.1  2e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0494  NnrS family protein  26.27 
 
 
426 aa  75.1  2e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.506659  normal  0.505655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  27.06 
 
 
391 aa  73.9  5e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  24.94 
 
 
393 aa  72.8  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  26.16 
 
 
409 aa  70.1  8e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  25.72 
 
 
406 aa  68.9  2e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  23.37 
 
 
418 aa  68.9  2e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  22.25 
 
 
400 aa  67.8  3e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  25.53 
 
 
394 aa  67.4  4e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  25 
 
 
408 aa  67.8  4e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  36.59 
 
 
408 aa  66.6  8e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  24.11 
 
 
392 aa  66.6  8e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  24.74 
 
 
406 aa  66.2  1e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  2.07371e-09 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  25.21 
 
 
399 aa  65.9  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  24.04 
 
 
392 aa  65.1  2e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  27.54 
 
 
393 aa  65.5  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1450  NnrS family protein  25.59 
 
 
425 aa  65.1  2e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.9412  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  22.74 
 
 
392 aa  64.7  3e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  23.35 
 
 
390 aa  63.9  6e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  24.88 
 
 
442 aa  63.5  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  39.39 
 
 
397 aa  62.4  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  25.49 
 
 
401 aa  62.4  1e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  25.36 
 
 
407 aa  61.6  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  25.36 
 
 
407 aa  61.6  2e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  23.25 
 
 
390 aa  61.6  2e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.40024e-07  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  25.36 
 
 
407 aa  61.6  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  23.41 
 
 
407 aa  60.8  4e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  25.12 
 
 
407 aa  60.8  4e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  25.12 
 
 
407 aa  60.5  5e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  23.63 
 
 
422 aa  59.3  1e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  23.66 
 
 
394 aa  59.7  1e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  25.43 
 
 
395 aa  58.2  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  36.36 
 
 
403 aa  57.4  5e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  3.01222e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  37.04 
 
 
403 aa  57  6e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  32.63 
 
 
404 aa  55.5  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  34.95 
 
 
414 aa  53.5  7e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  24.07 
 
 
397 aa  53.1  9e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  22.64 
 
 
394 aa  53.1  9e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  35.65 
 
 
424 aa  53.1  9e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  32.35 
 
 
393 aa  51.6  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  25.69 
 
 
390 aa  50.8  4e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  36.36 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  31.71 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  37.14 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  25.79 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  34.29 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  43.75 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  23.06 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  24.87 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  31.07 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  36.36 
 
 
398 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  23.19 
 
 
431 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  39.19 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  25.19 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  37.84 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  37.84 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  37.84 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  25.77 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  36.84 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  36.63 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  36.63 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  39.19 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  23.56 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  24.64 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>