More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1332 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  100 
 
 		 517 aa  1033    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  37.52 
 
 		 531 aa  335  9e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  28.4 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  30.48 
 
 		 325 aa  127  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  31.72 
 
 		 265 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  30.48 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.03 
 
 		 277 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  25.74 
 
 		 405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  31.02 
 
 		 302 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  28.57 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  32.54 
 
 		 231 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.57 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  24.33 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.2 
 
 		 346 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.71 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  26.99 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  33.33 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  24.57 
 
 		 279 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  28.64 
 
 		 357 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  24.63 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  31.33 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  26.03 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  24.75 
 
 		 310 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  24.83 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  36.23 
 
 		 253 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  28.69 
 
 		 228 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.91 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  25.65 
 
 		 282 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  25.98 
 
 		 276 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.9 
 
 		 299 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.03 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  24.92 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.21 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  32.08 
 
 		 267 aa  97.8  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  24.07 
 
 		 276 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  35.67 
 
 		 270 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  32.66 
 
 		 268 aa  97.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.63 
 
 		 263 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  24.3 
 
 		 277 aa  97.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  30.89 
 
 		 276 aa  97.1  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  23.79 
 
 		 289 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  23.13 
 
 		 289 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  24.84 
 
 		 290 aa  96.7  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  27.23 
 
 		 284 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  27.23 
 
 		 284 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  27.23 
 
 		 284 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  27.23 
 
 		 284 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  32.93 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  33.54 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  32.93 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  33.54 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  23.79 
 
 		 289 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  32.93 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  21.9 
 
 		 330 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  25.54 
 
 		 294 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  22.22 
 
 		 334 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  22.15 
 
 		 330 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.09 
 
 		 350 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  27.62 
 
 		 276 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  24.26 
 
 		 275 aa  93.6  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  30.05 
 
 		 269 aa  94  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  21.9 
 
 		 334 aa  93.6  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 		 335 aa  93.6  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  23.7 
 
 		 289 aa  93.2  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  32.7 
 
 		 272 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  24.3 
 
 		 409 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.08 
 
 		 350 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  22.73 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  21.93 
 
 		 330 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 385 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  35.48 
 
 		 280 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.07 
 
 		 350 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  22.04 
 
 		 276 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  35.07 
 
 		 274 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  28.33 
 
 		 273 aa  91.3  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.07 
 
 		 350 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  35.07 
 
 		 274 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  35.07 
 
 		 274 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  34.67 
 
 		 280 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  22.29 
 
 		 337 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  25.9 
 
 		 272 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 274 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  28.26 
 
 		 331 aa  90.9  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.78 
 
 		 350 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  24.15 
 
 		 298 aa  90.5  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 264 aa  90.1  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  25.56 
 
 		 277 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  21.17 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 265 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  24 
 
 		 276 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 274 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 274 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  25.84 
 
 		 274 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  26.24 
 
 		 212 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.91 
 
 		 335 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  26.51 
 
 		 271 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>