118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1298 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  59.63 
 
 		 760 aa  920    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  59.63 
 
 		 760 aa  920    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  51.38 
 
 		 663 aa  706    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  100 
 
 		 865 aa  1797    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  67.28 
 
 		 864 aa  1261    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  69.28 
 
 		 864 aa  1249    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  68.35 
 
 		 863 aa  1231    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  68.29 
 
 		 862 aa  1241    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1928  nitrous-oxide reductase  44.96 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  41.55 
 
 		 632 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  42.88 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  42.71 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  41.97 
 
 		 620 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  39.93 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  41.29 
 
 		 647 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0693  Nitrous-oxide reductase  39.68 
 
 		 658 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1165  nitrous-oxide reductase  33.77 
 
 		 699 aa  315  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.804263  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3078  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 631 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1074  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 640 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3400  nitrous-oxide reductase  34.07 
 
 		 628 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  32.96 
 
 		 639 aa  303  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20200  nitrous-oxide reductase  34.05 
 
 		 636 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1738  nitrous-oxide reductase  34.7 
 
 		 636 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2219  nitrous-oxide reductase  32.38 
 
 		 628 aa  298  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000181055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  32.43 
 
 		 645 aa  297  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  33.07 
 
 		 649 aa  294  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  32.69 
 
 		 645 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0275  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 		 639 aa  293  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.275953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4346  nitrous-oxide reductase  33.39 
 
 		 638 aa  293  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0394445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  33.93 
 
 		 690 aa  292  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2564  nitrous-oxide reductase  33.06 
 
 		 628 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  32.85 
 
 		 648 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1428  nitrous-oxide reductase  32.55 
 
 		 630 aa  290  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0251  nitrous-oxide reductase  32.75 
 
 		 639 aa  290  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  33.6 
 
 		 691 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  33.6 
 
 		 693 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  33.6 
 
 		 655 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4732  nitrous-oxide reductase  34.09 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 660 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1389  nitrous-oxide reductase  32.53 
 
 		 646 aa  283  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  33.66 
 
 		 650 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3319  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 644 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0698213  normal  0.2184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3194  nitrous-oxide reductase  33.28 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  33.55 
 
 		 644 aa  278  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4219  nitrous-oxide reductase  33.87 
 
 		 652 aa  276  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  33.77 
 
 		 649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  33.77 
 
 		 649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  32.63 
 
 		 646 aa  273  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  33.44 
 
 		 646 aa  272  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  33.12 
 
 		 646 aa  267  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  32.79 
 
 		 645 aa  261  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  30.62 
 
 		 652 aa  258  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  31.37 
 
 		 160 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  31 
 
 		 166 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 535 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 535 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 487 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  32.97 
 
 		 125 aa  54.3  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 487 aa  54.3  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 535 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  32.97 
 
 		 277 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 487 aa  53.9  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 535 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  26.73 
 
 		 153 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 535 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  28.71 
 
 		 160 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  30.1 
 
 		 322 aa  52.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 169 aa  52.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 		 327 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 262 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 327 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.77 
 
 		 316 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  27.93 
 
 		 266 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 339 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 253 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.33 
 
 		 384 aa  48.5  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  32.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 320 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 320 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  32.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  28.43 
 
 		 238 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 334 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  32.91 
 
 		 125 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 326 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  20.53 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  31.65 
 
 		 262 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 264 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 156 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.75 
 
 		 324 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.43 
 
 		 311 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  29.27 
 
 		 168 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  28.43 
 
 		 238 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  27.84 
 
 		 152 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>