More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1280 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  41.27 
 
 		 944 aa  680    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 889 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  41.9 
 
 		 895 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 889 aa  1831    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  60.25 
 
 		 844 aa  1096    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 		 899 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  39.96 
 
 		 905 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 		 919 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 895 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 		 889 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 885 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  35.65 
 
 		 863 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  35.41 
 
 		 869 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 863 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 862 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  34.67 
 
 		 863 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 863 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 859 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 917 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 868 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 		 903 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 		 831 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 		 842 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 772 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  30.3 
 
 		 558 aa  191  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  29.27 
 
 		 558 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  30.77 
 
 		 538 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 610 aa  184  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  29.07 
 
 		 541 aa  180  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  30.23 
 
 		 536 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  33.91 
 
 		 638 aa  178  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  31.82 
 
 		 535 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  33.63 
 
 		 650 aa  173  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  29.77 
 
 		 494 aa  173  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  28.84 
 
 		 532 aa  171  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 529 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  34.28 
 
 		 540 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  29.83 
 
 		 541 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 531 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 521 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  29.66 
 
 		 522 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  30.37 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  30.37 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  29.86 
 
 		 533 aa  145  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  27.61 
 
 		 737 aa  127  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  27.49 
 
 		 501 aa  125  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 658 aa  124  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.12 
 
 		 712 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 490 aa  121  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  27.37 
 
 		 749 aa  118  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  26.08 
 
 		 716 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  26.39 
 
 		 652 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.39 
 
 		 652 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 533 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  26.44 
 
 		 740 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  26.23 
 
 		 295 aa  115  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  30.13 
 
 		 778 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.6 
 
 		 652 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 514 aa  110  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.25 
 
 		 768 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.93 
 
 		 718 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 295 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 591 aa  108  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 620 aa  107  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.39 
 
 		 834 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.39 
 
 		 831 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.85 
 
 		 586 aa  106  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  26.35 
 
 		 683 aa  105  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 505 aa  105  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.42 
 
 		 659 aa  105  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  25.57 
 
 		 555 aa  104  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.8 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.8 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  24.8 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 501 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  24.8 
 
 		 655 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.19 
 
 		 804 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 501 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  24.8 
 
 		 655 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  24.8 
 
 		 655 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  24.8 
 
 		 657 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.79 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.32 
 
 		 822 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 494 aa  101  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 501 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 501 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.62 
 
 		 672 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  24.67 
 
 		 661 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.47 
 
 		 794 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 659 aa  98.6  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  26.55 
 
 		 867 aa  98.2  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.63 
 
 		 810 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.66 
 
 		 811 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  25.12 
 
 		 672 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.45 
 
 		 422 aa  97.8  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.28 
 
 		 1135 aa  97.4  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  25.47 
 
 		 788 aa  97.8  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>