More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1272 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  62.76 
 
 
155 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  62.07 
 
 
155 aa  191  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  58.9 
 
 
155 aa  189  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  57.33 
 
 
154 aa  185  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  60.96 
 
 
151 aa  184  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  60.84 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  60.84 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  60.84 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  58.74 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  45.65 
 
 
143 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  40.69 
 
 
143 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  40.69 
 
 
143 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 
144 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  39.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  39.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  39.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  36.42 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  42.54 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  42.54 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  40.44 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  40 
 
 
143 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  39.86 
 
 
151 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  39.16 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  40.3 
 
 
149 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  39.1 
 
 
176 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  43.85 
 
 
142 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  40.3 
 
 
138 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  38.69 
 
 
140 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  41.04 
 
 
140 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  37.67 
 
 
147 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  39.55 
 
 
155 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  39.44 
 
 
146 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  37.88 
 
 
167 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  37.88 
 
 
167 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  40.14 
 
 
143 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  37.88 
 
 
167 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  40.44 
 
 
148 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 
145 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.76 
 
 
152 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  39.55 
 
 
145 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  41.54 
 
 
141 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 
142 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 
138 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 
142 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  38.97 
 
 
154 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  39.26 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  38.81 
 
 
146 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 
142 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  39.55 
 
 
139 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  39.26 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  40.88 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  39.71 
 
 
145 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 
148 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  39.71 
 
 
155 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  40.88 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  40.88 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  40.88 
 
 
142 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  40.88 
 
 
142 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  39.42 
 
 
146 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  40.15 
 
 
142 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  36.11 
 
 
149 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  37.24 
 
 
144 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  36.11 
 
 
149 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 
140 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  38.85 
 
 
143 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  37.86 
 
 
159 aa  100  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  40.15 
 
 
142 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  37.5 
 
 
151 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  38.85 
 
 
143 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  38.57 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  40.58 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  44.19 
 
 
143 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  39.13 
 
 
145 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  38.97 
 
 
143 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  41.09 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  40.98 
 
 
137 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  38.85 
 
 
143 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  38.85 
 
 
143 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  38.85 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  40.15 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  38.24 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  40.15 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>