198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1239 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1779  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.56 
 
 
669 aa  787    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0307976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0963  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.7 
 
 
683 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2642  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.35 
 
 
673 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0862  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  69.55 
 
 
698 aa  1025    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0052  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  79.94 
 
 
701 aa  1182    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
583 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00137002  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2171  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.98 
 
 
676 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00664522  hitchhiker  0.00155539 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
583 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1239  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 
698 aa  1459    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1276  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.67 
 
 
673 aa  768    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.21 
 
 
596 aa  752    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0368  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.47 
 
 
675 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3517  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.24 
 
 
673 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5139  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.84 
 
 
574 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1782  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.35 
 
 
687 aa  777    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.309606  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.22 
 
 
629 aa  725    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39690  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.78 
 
 
675 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192369  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.96 
 
 
683 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2340  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.54 
 
 
591 aa  736    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855235  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0021  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  72.38 
 
 
689 aa  1056    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2989  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.56 
 
 
581 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.935687  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0087  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.02 
 
 
678 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2383  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
583 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
587 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2685  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
583 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2742  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
583 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.05 
 
 
583 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.35 
 
 
687 aa  778    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4058  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  72.81 
 
 
707 aa  1052    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.74 
 
 
627 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  60.74 
 
 
608 aa  758    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  57.94 
 
 
636 aa  737    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3365  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.2 
 
 
675 aa  772    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172417  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4657  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.96 
 
 
683 aa  776    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.68774  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  69.85 
 
 
893 aa  971    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  73.12 
 
 
701 aa  1072    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.31 
 
 
675 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.54 
 
 
591 aa  736    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.529352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1897  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  72.83 
 
 
700 aa  1071    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000617448  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0454  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.7 
 
 
703 aa  1062    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000238531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1331  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.79 
 
 
708 aa  635  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0843156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.67 
 
 
695 aa  616  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.01 
 
 
800 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.65 
 
 
692 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.96 
 
 
676 aa  608  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.177908  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.54 
 
 
816 aa  603  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.98 
 
 
813 aa  601  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.92 
 
 
730 aa  597  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.02 
 
 
690 aa  597  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.12 
 
 
706 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.74 
 
 
705 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.4 
 
 
719 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.61 
 
 
730 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.56 
 
 
718 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.46 
 
 
630 aa  569  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.4 
 
 
721 aa  572  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.71 
 
 
715 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.48 
 
 
710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.46 
 
 
686 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.68 
 
 
709 aa  561  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.32 
 
 
695 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.07 
 
 
696 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.43 
 
 
697 aa  555  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.68 
 
 
627 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.88 
 
 
681 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.73 
 
 
704 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.59 
 
 
685 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.95 
 
 
638 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  48.31 
 
 
623 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.01 
 
 
689 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  42.72 
 
 
636 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0922  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  41.92 
 
 
603 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0018873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.57 
 
 
639 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1315  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  30.09 
 
 
665 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  28.27 
 
 
604 aa  236  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.3 
 
 
606 aa  210  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.48 
 
 
606 aa  210  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.26 
 
 
709 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.96 
 
 
768 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.07 
 
 
791 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.97 
 
 
791 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.82 
 
 
791 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26 
 
 
794 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  25.83 
 
 
795 aa  157  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.17 
 
 
757 aa  150  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1709  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.13 
 
 
729 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.37084  normal  0.962823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.88 
 
 
656 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.674965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0320  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.88 
 
 
731 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.706326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.07 
 
 
676 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2811  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  24.96 
 
 
732 aa  137  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.140611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0009  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.21 
 
 
730 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0630863 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0048  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.84 
 
 
759 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.59 
 
 
788 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.681692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0351  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.03 
 
 
789 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.478958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.57 
 
 
705 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.65 
 
 
705 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.14 
 
 
704 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.93 
 
 
798 aa  111  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.63 
 
 
746 aa  111  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1878  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.72 
 
 
634 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.261956  normal  0.116679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>