More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1225 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  100 
 
 
431 aa  882    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  64.73 
 
 
434 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  62.93 
 
 
413 aa  545  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  61.56 
 
 
415 aa  534  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  60 
 
 
413 aa  529  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  60.15 
 
 
417 aa  520  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  59.17 
 
 
416 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  59.17 
 
 
416 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  58.44 
 
 
416 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  52.18 
 
 
414 aa  455  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  37.77 
 
 
442 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  35.37 
 
 
493 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  35.7 
 
 
453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  36.19 
 
 
470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  36.99 
 
 
441 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.35 
 
 
453 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  36.66 
 
 
443 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  38.52 
 
 
443 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  35.63 
 
 
443 aa  249  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  35.93 
 
 
461 aa  249  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  35.81 
 
 
443 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  35.4 
 
 
443 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  35.17 
 
 
443 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  35.58 
 
 
443 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  35.58 
 
 
443 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  35.35 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  36.54 
 
 
443 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  34.15 
 
 
469 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  35.75 
 
 
464 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  35.7 
 
 
447 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.04 
 
 
466 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  34.65 
 
 
443 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  34.65 
 
 
443 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  31.87 
 
 
441 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  34.65 
 
 
443 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.87 
 
 
457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  32.43 
 
 
465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.5 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  31.63 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 
459 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
460 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  34.78 
 
 
461 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  34.05 
 
 
513 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  33.98 
 
 
504 aa  229  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.16 
 
 
470 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.72 
 
 
493 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  33.65 
 
 
461 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  33.89 
 
 
441 aa  226  8e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  33.89 
 
 
441 aa  226  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  32.13 
 
 
453 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  32.3 
 
 
514 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  32.06 
 
 
454 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.75 
 
 
443 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  33.02 
 
 
476 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  32.78 
 
 
464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  33.41 
 
 
489 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  32.06 
 
 
460 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  32.06 
 
 
460 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  30.25 
 
 
484 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  32.09 
 
 
453 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 
484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 
459 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  31.97 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  33.5 
 
 
489 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  32.95 
 
 
454 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  31.49 
 
 
484 aa  219  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  31.63 
 
 
492 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  32.45 
 
 
455 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  31.68 
 
 
912 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.01 
 
 
506 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  32.69 
 
 
876 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.36 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.78 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  30.88 
 
 
459 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  31.72 
 
 
411 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  32.22 
 
 
479 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  32.2 
 
 
462 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  32.37 
 
 
494 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  30.61 
 
 
442 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  30.83 
 
 
439 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  33.73 
 
 
440 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.52 
 
 
942 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  31.84 
 
 
414 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  32.19 
 
 
477 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
530 aa  206  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  31.95 
 
 
518 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.37 
 
 
440 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  31.57 
 
 
482 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  32.17 
 
 
509 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  32.03 
 
 
501 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  32.44 
 
 
550 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  31.37 
 
 
450 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
954 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  31.84 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  32.62 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  31.87 
 
 
411 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  29.43 
 
 
458 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  30.12 
 
 
450 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>