263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1116 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
145 aa  298  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0842  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  65.25 
 
 
142 aa  199  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  52.17 
 
 
147 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2228  ribose 5-phosphate isomerase B  53.57 
 
 
147 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  3.13562e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  49.64 
 
 
162 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0682  ribose 5-phosphate isomerase B  52.48 
 
 
145 aa  153  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  49.65 
 
 
149 aa  153  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  49.65 
 
 
149 aa  153  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  51.85 
 
 
147 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.05 
 
 
148 aa  153  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  52.48 
 
 
149 aa  153  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  1.82185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  52.17 
 
 
147 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  50.71 
 
 
148 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.55 
 
 
147 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.80792e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2929  ribose 5-phosphate isomerase B  50.72 
 
 
147 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1171  ribose 5-phosphate isomerase B  52.86 
 
 
148 aa  152  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0563702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.89 
 
 
144 aa  151  3e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  8.76493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.77 
 
 
143 aa  150  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  48.25 
 
 
322 aa  150  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0481  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.28 
 
 
150 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
149 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  55 
 
 
145 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  52.08 
 
 
145 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
149 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.92 
 
 
152 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  49.65 
 
 
148 aa  146  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  51.08 
 
 
149 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.29497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  48.95 
 
 
143 aa  146  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  48.95 
 
 
143 aa  146  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  47.55 
 
 
149 aa  145  1e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  52.48 
 
 
150 aa  146  1e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1553  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  52.94 
 
 
147 aa  146  1e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  45.39 
 
 
148 aa  145  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.23 
 
 
142 aa  145  2e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.15199e-06  hitchhiker  1.8847e-05 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1042  ribose 5-phosphate isomerase B  51.05 
 
 
148 aa  145  2e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.35 
 
 
142 aa  145  2e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
566 aa  144  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
149 aa  144  4e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0932  ribose 5-phosphate isomerase B  53.57 
 
 
145 aa  144  4e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  46.85 
 
 
149 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  46.85 
 
 
149 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  46.85 
 
 
149 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  46.85 
 
 
149 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  51.43 
 
 
145 aa  144  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.61 
 
 
149 aa  143  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  8.11694e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  46.15 
 
 
149 aa  143  7e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.95 
 
 
146 aa  143  7e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.14 
 
 
149 aa  143  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  51.47 
 
 
146 aa  143  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1003  ribose 5-phosphate isomerase B  52.86 
 
 
145 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0852  ribose 5-phosphate isomerase B  46.72 
 
 
150 aa  141  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00452736  normal  0.320057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
148 aa  141  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
147 aa  140  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.86604e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
147 aa  140  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
147 aa  140  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.46279e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
147 aa  140  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.49757e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  45.45 
 
 
152 aa  140  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
147 aa  140  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.05511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  47.52 
 
 
144 aa  140  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  47.26 
 
 
147 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.0835e-10  unclonable  3.67009e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  47.89 
 
 
147 aa  140  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  9.08103e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.28 
 
 
146 aa  140  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  47.89 
 
 
147 aa  140  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.04947e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  48.59 
 
 
147 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  46.58 
 
 
147 aa  139  1e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  46.58 
 
 
147 aa  139  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.11048e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  48.25 
 
 
181 aa  139  1e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  48.57 
 
 
145 aa  139  1e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.43 
 
 
148 aa  139  2e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.57 
 
 
153 aa  138  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1828  ribose-5-phosphate isomerase  47.06 
 
 
162 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  45.39 
 
 
370 aa  135  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.39 
 
 
144 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5648  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.83 
 
 
160 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609634  normal  0.681058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.14 
 
 
153 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1446  ribose 5-phosphate isomerase B  49.26 
 
 
144 aa  135  3e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.396381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  47.22 
 
 
148 aa  134  3e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  46.1 
 
 
150 aa  134  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  43.97 
 
 
151 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  40 
 
 
149 aa  132  2e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.41182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1019  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.71 
 
 
153 aa  132  2e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.83 
 
 
149 aa  131  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0638  ribose 5-phosphate isomerase B  48.25 
 
 
148 aa  131  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0815876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.06 
 
 
149 aa  131  4e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.05549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0401  ribose/galactose isomerase  48.25 
 
 
149 aa  131  4e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0557061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  43.17 
 
 
148 aa  130  7e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.17 
 
 
149 aa  129  1e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1864  ribose 5-phosphate isomerase B  50.37 
 
 
149 aa  129  2e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45 
 
 
154 aa  129  2e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  41.13 
 
 
150 aa  127  4e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3631  ribose 5-phosphate isomerase B  45.77 
 
 
145 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  41.13 
 
 
148 aa  125  1e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2124  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.29 
 
 
150 aa  126  1e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.43 
 
 
151 aa  125  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  43.06 
 
 
149 aa  125  2e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21560  ribose-5-phosphate isomerase  43.06 
 
 
146 aa  124  4e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971955  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.67 
 
 
149 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.91154e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.26 
 
 
148 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.72 
 
 
151 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  44.37 
 
 
152 aa  122  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>