More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1070 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1070  ExsB  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  62.9 
 
 
224 aa  279  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  61.93 
 
 
223 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  62.9 
 
 
224 aa  278  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  62.9 
 
 
224 aa  278  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  61.47 
 
 
221 aa  276  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  61.01 
 
 
223 aa  274  8e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  58.45 
 
 
220 aa  271  8e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  61.36 
 
 
221 aa  270  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  51.14 
 
 
222 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  48.17 
 
 
226 aa  214  6e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  45.58 
 
 
258 aa  213  2e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  44.14 
 
 
229 aa  211  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  48.17 
 
 
221 aa  211  8e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  45 
 
 
227 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  47.27 
 
 
226 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  47.03 
 
 
222 aa  208  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  46.33 
 
 
226 aa  207  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  46.33 
 
 
220 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  42.92 
 
 
243 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  45.93 
 
 
218 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  47.73 
 
 
227 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  41.36 
 
 
251 aa  200  2e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  43.64 
 
 
226 aa  199  2e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  47.35 
 
 
229 aa  199  4e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  46.15 
 
 
257 aa  194  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  40.45 
 
 
271 aa  184  1e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  41.96 
 
 
224 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  44.14 
 
 
222 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  44.54 
 
 
230 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  41.78 
 
 
224 aa  179  3e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  41.52 
 
 
224 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  43.3 
 
 
232 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  44.64 
 
 
226 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  44.64 
 
 
244 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  42.73 
 
 
228 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  40.27 
 
 
226 aa  175  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  40.18 
 
 
226 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  43.17 
 
 
224 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  42.6 
 
 
225 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  43.17 
 
 
224 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  43.17 
 
 
224 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  44.39 
 
 
237 aa  174  1e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  43.17 
 
 
225 aa  172  3e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  41.89 
 
 
222 aa  171  6e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  42.73 
 
 
224 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  43.3 
 
 
225 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  42.29 
 
 
224 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  42.38 
 
 
230 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  41.59 
 
 
227 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  40.89 
 
 
224 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  39.29 
 
 
227 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  40.54 
 
 
233 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  43.3 
 
 
229 aa  168  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  41.23 
 
 
229 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  41.23 
 
 
229 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  40.09 
 
 
230 aa  167  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  39.37 
 
 
226 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  39.52 
 
 
225 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  45.09 
 
 
230 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  42.34 
 
 
232 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  42.79 
 
 
226 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  43.11 
 
 
228 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  40.34 
 
 
228 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  41.85 
 
 
224 aa  166  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  41.05 
 
 
229 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  41.96 
 
 
225 aa  166  3e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  39.52 
 
 
225 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  38.12 
 
 
229 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  41.33 
 
 
237 aa  165  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  45.09 
 
 
230 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  40.69 
 
 
225 aa  164  1e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  40.89 
 
 
227 aa  163  2e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  41.67 
 
 
229 aa  163  2e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  40.1 
 
 
225 aa  163  2e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  39.64 
 
 
233 aa  163  2e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  40.43 
 
 
241 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  43.3 
 
 
229 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  43.95 
 
 
221 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  40.55 
 
 
224 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  42.15 
 
 
228 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  38.24 
 
 
246 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  41.15 
 
 
230 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  39.62 
 
 
224 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  40.81 
 
 
223 aa  158  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  40.27 
 
 
237 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  39.46 
 
 
236 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  37.91 
 
 
229 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  41.07 
 
 
226 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  40.27 
 
 
233 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  41.07 
 
 
244 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  39.62 
 
 
224 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  41.07 
 
 
228 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  42.48 
 
 
224 aa  155  5e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  37.33 
 
 
227 aa  155  5e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  38.35 
 
 
231 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  41.07 
 
 
228 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  39.62 
 
 
224 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  40.43 
 
 
234 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  42.6 
 
 
224 aa  152  3e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>