More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1056 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  416  1e-115  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
198 aa  65.9  4e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
205 aa  63.5  2e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
258 aa  63.2  3e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
190 aa  63.2  3e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
204 aa  62.4  5e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
203 aa  61.6  7e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
217 aa  61.6  7e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
200 aa  61.2  1e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
217 aa  60.8  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
204 aa  60.1  2e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 
223 aa  60.5  2e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
214 aa  60.1  2e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
212 aa  60.5  2e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 
203 aa  59.7  3e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  49.06 
 
 
213 aa  59.7  3e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
232 aa  59.7  3e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
191 aa  58.9  4e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
208 aa  58.9  5e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
286 aa  58.9  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
195 aa  58.5  7e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 
196 aa  58.2  8e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
204 aa  58.2  9e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  37.21 
 
 
196 aa  57.8  1e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  40.62 
 
 
201 aa  57.8  1e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
256 aa  57.4  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  25.87 
 
 
214 aa  57.4  2e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
183 aa  56.6  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
191 aa  56.6  2e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
183 aa  56.2  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
192 aa  56.2  3e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
210 aa  56.6  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 
232 aa  55.8  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.4 
 
 
219 aa  55.5  5e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 
287 aa  55.5  5e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 
248 aa  55.5  5e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
213 aa  55.5  5e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
190 aa  55.5  5e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
208 aa  55.8  5e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
244 aa  55.5  6e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
231 aa  55.5  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
205 aa  55.5  6e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 
207 aa  55.1  6e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 
201 aa  55.1  6e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 
288 aa  55.1  7e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 
216 aa  55.1  7e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
183 aa  55.1  7e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 
212 aa  55.1  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 
212 aa  55.1  8e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
232 aa  55.1  8e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37.74 
 
 
200 aa  54.7  9e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
212 aa  54.7  9e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 
190 aa  54.7  9e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 
190 aa  54.7  9e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
222 aa  54.3  1e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 
198 aa  54.3  1e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
190 aa  54.3  1e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
186 aa  54.3  1e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50 
 
 
213 aa  54.3  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
291 aa  53.9  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
202 aa  54.3  1e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 
201 aa  54.3  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 
186 aa  53.9  1e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
193 aa  54.3  1e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
190 aa  54.7  1e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 
204 aa  53.9  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 
198 aa  54.7  1e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
187 aa  53.9  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  25.29 
 
 
194 aa  54.3  1e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.02791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
220 aa  54.7  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
228 aa  53.9  1e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 
237 aa  54.3  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
191 aa  53.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
218 aa  53.5  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
226 aa  53.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
202 aa  53.9  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
231 aa  53.9  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 
310 aa  53.5  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 
211 aa  53.5  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
185 aa  53.5  2e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 
239 aa  53.5  2e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
193 aa  53.5  2e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
210 aa  53.5  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
219 aa  53.9  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  42.62 
 
 
195 aa  53.1  2e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.22834e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
291 aa  53.9  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 
194 aa  53.5  2e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 
210 aa  53.5  2e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  38.33 
 
 
209 aa  53.5  2e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
204 aa  53.5  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 
255 aa  53.9  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
221 aa  53.9  2e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
234 aa  53.5  2e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 
214 aa  53.5  2e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  39.19 
 
 
185 aa  53.5  2e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
221 aa  53.5  2e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
226 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
219 aa  53.9  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
189 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
191 aa  53.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>