124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1028 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  100 
 
 
293 aa  607  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  52.92 
 
 
291 aa  301  7.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  45.8 
 
 
296 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  45.1 
 
 
282 aa  260  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  45.77 
 
 
282 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  45.45 
 
 
282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.18 
 
 
282 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  44.72 
 
 
282 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  45.07 
 
 
282 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  41.26 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.71 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  44.1 
 
 
282 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.24 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  37.37 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  37.02 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.67 
 
 
301 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  37.67 
 
 
301 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  37.93 
 
 
301 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  37.59 
 
 
285 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.25 
 
 
304 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.31 
 
 
297 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.31 
 
 
297 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.9 
 
 
297 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  38.91 
 
 
293 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  38.91 
 
 
293 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.91 
 
 
293 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  33.8 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.11 
 
 
300 aa  188  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.57 
 
 
293 aa  188  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  36.52 
 
 
300 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  31.67 
 
 
290 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  34.39 
 
 
299 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  36.01 
 
 
300 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.21 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.66 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.31 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.18 
 
 
294 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  35.54 
 
 
308 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.94 
 
 
305 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.81 
 
 
300 aa  168  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.52 
 
 
295 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.52 
 
 
295 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.6 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.45 
 
 
294 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.51 
 
 
326 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  32.08 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  34.39 
 
 
292 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  32.52 
 
 
296 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.41 
 
 
285 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.51 
 
 
334 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.75 
 
 
292 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.65 
 
 
296 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.42 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.67 
 
 
462 aa  155  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  33.45 
 
 
306 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.02 
 
 
307 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.64 
 
 
284 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.27 
 
 
294 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.6 
 
 
306 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.27 
 
 
300 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.22 
 
 
295 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  32.64 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  31.72 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.01 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  32.17 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30 
 
 
290 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.74 
 
 
303 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.9 
 
 
303 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.45 
 
 
317 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.03 
 
 
303 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  31.03 
 
 
303 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  31.29 
 
 
299 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.13 
 
 
317 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.57 
 
 
305 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.12 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.79 
 
 
296 aa  139  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.2 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.71 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.56 
 
 
288 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.57 
 
 
281 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  28.33 
 
 
349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  27.87 
 
 
502 aa  129  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.4 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.14 
 
 
300 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.14 
 
 
300 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.87 
 
 
295 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.03 
 
 
497 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  28.52 
 
 
290 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  29.2 
 
 
296 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.18 
 
 
508 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.87 
 
 
502 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  27.59 
 
 
281 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.38 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.71 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  28.93 
 
 
502 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.51 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  26.41 
 
 
281 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  25.25 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1184  Heterodisulfide reductase subunit B-like protein  23.53 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.910208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  26.32 
 
 
717 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>