More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0988 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
652 aa  1293    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.73 
 
 
682 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
708 aa  326  9e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  52.08 
 
 
563 aa  317  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  48.87 
 
 
563 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
713 aa  303  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
656 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 
650 aa  292  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  46.69 
 
 
656 aa  288  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
563 aa  279  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
546 aa  279  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  47.01 
 
 
566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 
633 aa  261  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
625 aa  234  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
627 aa  234  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
536 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 
621 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  29.04 
 
 
661 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
658 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 
650 aa  210  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
533 aa  206  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
530 aa  204  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
720 aa  201  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 
720 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  41.88 
 
 
626 aa  191  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.66 
 
 
661 aa  190  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 
653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.05 
 
 
664 aa  184  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  hitchhiker  0.00420774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 
662 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.33 
 
 
664 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 
653 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.89 
 
 
666 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 
653 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0413  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 
653 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  29.65 
 
 
661 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 
664 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.01 
 
 
646 aa  171  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.457093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 
662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.43 
 
 
664 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0315396  normal  0.0961625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 
664 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0377955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2657  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.54 
 
 
646 aa  159  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.12 
 
 
649 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.38 
 
 
664 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.16 
 
 
700 aa  157  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 
664 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257458  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0920  nitrate and nitrite sensing methyl-accepting chemotaxis protein  28.87 
 
 
662 aa  156  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  27.2 
 
 
651 aa  155  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.89 
 
 
668 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 
637 aa  153  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 
547 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.15 
 
 
664 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.106787  normal  0.536367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
664 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.119789  normal  0.182995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.15 
 
 
664 aa  150  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0832618  normal  0.158688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 
530 aa  148  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 
620 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1941  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.98 
 
 
861 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 
620 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
697 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 
380 aa  145  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 
548 aa  144  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.04 
 
 
672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  30.23 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
620 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
620 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.72 
 
 
663 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293812  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  28.98 
 
 
672 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 
620 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 
568 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  29.44 
 
 
549 aa  138  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 
620 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0106  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.22 
 
 
1002 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 
620 aa  137  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 
620 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.2 
 
 
372 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
674 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  31.44 
 
 
568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 
620 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.05 
 
 
564 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 
541 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
636 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 
601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
640 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 
543 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 
548 aa  134  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  31.82 
 
 
541 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  31.89 
 
 
689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 
668 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 
680 aa  132  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 
621 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.57 
 
 
531 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 
584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  30.77 
 
 
660 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 
622 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  26.81 
 
 
544 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.11 
 
 
679 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  31.2 
 
 
623 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
674 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>