50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0906 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0906  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  56.76 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  54.05 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1610  protein of unknown function DUF465  58.97 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  47.89 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  47.89 
 
 
72 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  45.33 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  49.28 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  49.28 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  48.65 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  44 
 
 
73 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  50.72 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  49.3 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  43.24 
 
 
71 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  47.22 
 
 
71 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.336410000000001e-19 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  0.0000000000000487786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1650  hypothetical protein  43.48 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  45.28 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  44.16 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  44.93 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  44.16 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0719  FlhB domain-containing protein  42.47 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.322563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  31.94 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  43.48 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  43.48 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  46.48 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  43.94 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0440  hypothetical protein  46.03 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3404  hypothetical protein  36 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  42.03 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  32.86 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  32 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2075  hypothetical protein  38.57 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0910666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1796  hypothetical protein  38.57 
 
 
82 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  35.29 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.348836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>