More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0885 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  100 
 
 
331 aa  657    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  33.55 
 
 
371 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  38.46 
 
 
353 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  38.46 
 
 
396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  41.49 
 
 
407 aa  159  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  34.03 
 
 
395 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
388 aa  155  9e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
388 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  34.7 
 
 
389 aa  143  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
375 aa  143  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  29.93 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  30.59 
 
 
374 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  35.56 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
405 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
405 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  29.17 
 
 
393 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  33.84 
 
 
497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  29.77 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
403 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
465 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
457 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
353 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  27.71 
 
 
430 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  27.71 
 
 
430 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  25.25 
 
 
443 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  31.46 
 
 
405 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  26.81 
 
 
368 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1791  sensor histidine kinase  30.53 
 
 
395 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  30.63 
 
 
256 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  30.96 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1140  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
418 aa  99.4  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00613378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  25.1 
 
 
412 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1478  histidine kinase  30.17 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  27.65 
 
 
468 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  31.16 
 
 
629 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  29.19 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
421 aa  96.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
489 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  28.25 
 
 
599 aa  96.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.03 
 
 
458 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  28.06 
 
 
392 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  28.45 
 
 
427 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  25.96 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  24.44 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  27.76 
 
 
436 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  26.73 
 
 
438 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  27.64 
 
 
412 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  30.81 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  32.37 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
462 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  27.7 
 
 
416 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
422 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  30.24 
 
 
430 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  26.29 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  27.91 
 
 
429 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.81 
 
 
433 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.4 
 
 
461 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  27.03 
 
 
347 aa  94  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  27.35 
 
 
436 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
436 aa  93.2  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
419 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  28.57 
 
 
416 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.48 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  30 
 
 
357 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
459 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4843  histidine kinase  23.81 
 
 
405 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
433 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  26.1 
 
 
443 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
452 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  27.07 
 
 
511 aa  92  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
526 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  33.49 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
591 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  30.99 
 
 
356 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  27.36 
 
 
370 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  28.74 
 
 
416 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  28.3 
 
 
469 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  25.12 
 
 
405 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  27.19 
 
 
480 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
447 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
613 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
500 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  26.44 
 
 
372 aa  90.1  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  27.4 
 
 
542 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  30 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  27.63 
 
 
443 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.63 
 
 
501 aa  90.1  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
495 aa  89.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  27.63 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.15 
 
 
584 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  36.97 
 
 
473 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  28.51 
 
 
416 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0563  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
591 aa  89.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  36.28 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>