More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0837 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  100 
 
 
269 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  30.04 
 
 
226 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  31.33 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  30.38 
 
 
226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  31.49 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  31.2 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 
226 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  30.42 
 
 
229 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  29.03 
 
 
236 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 
225 aa  102  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
365 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  31.12 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  36.49 
 
 
566 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  29.41 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  31.2 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  28.16 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.37 
 
 
425 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  36 
 
 
564 aa  89.4  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0969  response regulator receiver domain-containing protein  40.44 
 
 
328 aa  89.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  28.69 
 
 
236 aa  89  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.67 
 
 
438 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  28.75 
 
 
228 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  28.22 
 
 
224 aa  85.5  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0968  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 
317 aa  85.5  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.730939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0987  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  22.36 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  22.94 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  24.47 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  24.68 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  24.35 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  27.08 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  27.08 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  27.08 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  26.41 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.63 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  23.66 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  26.61 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  25.54 
 
 
221 aa  79  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
692 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  23.01 
 
 
221 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  25.21 
 
 
227 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  25.11 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  25.11 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  23.48 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.95 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.95 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  24.57 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  23.95 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  23.38 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.49 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  23.38 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  24.68 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  24.15 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  23.38 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.58 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  23.38 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  24.17 
 
 
509 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  23.38 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  23.14 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  26.92 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  25 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0381  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.23 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  26.92 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  28.75 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  26.18 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.55 
 
 
953 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  22.18 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.68 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  22.18 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  25 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  22.78 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.5 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  26.75 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.75 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  22.18 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.68 
 
 
220 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  23.71 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  24.68 
 
 
223 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  38.84 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  24.07 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  25.43 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  23.53 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  25.96 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  22.94 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  24.15 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  23.81 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.89 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  22.59 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.38 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  22.18 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  24.18 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
636 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  24.48 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  38.02 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  22.94 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  23.81 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>