208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0800 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  100 
 
 		 369 aa  754    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  41.64 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  37.39 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  30.95 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  30.27 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.27 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  35.08 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.3 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  34.84 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.04 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25.18 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.92 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.01 
 
 		 433 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  30.16 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  32.2 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  31.72 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  34.09 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  29.49 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  28.27 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  32.95 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  30.66 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.51 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.1 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.9 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  24.56 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  29.43 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  28.03 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  24.23 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  28.98 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  23.32 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  23.32 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  25.91 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  29.1 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  23.36 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  28.11 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  22.88 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  23.64 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.41 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  24.58 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  24.58 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  24.58 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  24.4 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  26.65 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  24.9 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  27.42 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  24.73 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  21.51 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  24.89 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  22.87 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  21.13 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.06 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  28.18 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  23.31 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  21.72 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.03 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  19.64 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  28.26 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.2 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  26.94 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  21.5 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  26.25 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.4 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.04 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  27.96 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  22.54 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  23.75 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.9 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  23.89 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  26.63 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  25.42 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  22.76 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  29.33 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.54 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.77 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.34 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  31.39 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.99 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.95 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  22.83 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.82 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  30.08 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  20.3 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  24.42 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  22.12 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  21.79 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  21.66 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.82 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27.01 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  22.41 
 
 		 275 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.89 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>