50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0768 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  689    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  39.22 
 
 
351 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  38.54 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  40.11 
 
 
364 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  36.41 
 
 
345 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  36.36 
 
 
351 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  37.55 
 
 
354 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  34.62 
 
 
359 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  39.23 
 
 
435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  30.9 
 
 
327 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  33.83 
 
 
422 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  40.67 
 
 
310 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  38.1 
 
 
295 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  37 
 
 
435 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  32.52 
 
 
326 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  34.88 
 
 
940 aa  80.5  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.88 
 
 
1789 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  33.33 
 
 
1814 aa  75.9  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.57 
 
 
959 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.18 
 
 
2107 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.92 
 
 
1925 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  38.3 
 
 
582 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  35.77 
 
 
4798 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.61 
 
 
928 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  33.97 
 
 
1809 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  36.5 
 
 
679 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  35.46 
 
 
585 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  32.26 
 
 
1112 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  35.04 
 
 
541 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  31.18 
 
 
844 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.23 
 
 
1607 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  35.96 
 
 
428 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36.7 
 
 
466 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  36.11 
 
 
548 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  27.72 
 
 
4687 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  35.82 
 
 
3598 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  29.01 
 
 
532 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.09 
 
 
618 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36.79 
 
 
677 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  44.87 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.65 
 
 
1499 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  31.13 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  32.38 
 
 
1306 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  35.24 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  30.94 
 
 
960 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  23.75 
 
 
1805 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  25.93 
 
 
2682 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.43 
 
 
999 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.43 
 
 
1480 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.08 
 
 
2767 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>