41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0741 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  100 
 
 		 179 aa  347  5e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  43.59 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000401467  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  41.67 
 
 		 97 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  39.33 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0578  cytochrome c-553  49.28 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00244376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  43.68 
 
 		 98 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  46.38 
 
 		 102 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0127  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  35.96 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 418 aa  48.5  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  31.71 
 
 		 100 aa  48.1  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  34.02 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  36 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  33.33 
 
 		 100 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  30.36 
 
 		 222 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  38.57 
 
 		 324 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  36.11 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.82 
 
 		 311 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  27.08 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  33.8 
 
 		 104 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  34.21 
 
 		 287 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 206 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  34.67 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.29 
 
 		 217 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  32.39 
 
 		 104 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 318 aa  41.2  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  28.46 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>