202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0739 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  71.52 
 
 
166 aa  250  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  68.48 
 
 
166 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  69.09 
 
 
166 aa  241  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  68.48 
 
 
166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  67.27 
 
 
166 aa  237  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  64.24 
 
 
165 aa  225  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  63.03 
 
 
165 aa  223  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  55.76 
 
 
166 aa  203  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  54.55 
 
 
166 aa  201  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  55.15 
 
 
166 aa  200  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  53.94 
 
 
166 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  53.01 
 
 
164 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  50 
 
 
166 aa  167  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  53.89 
 
 
165 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  50.3 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  50.6 
 
 
165 aa  161  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  50.6 
 
 
164 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  50.59 
 
 
168 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  49.69 
 
 
164 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  48.17 
 
 
166 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  51.61 
 
 
158 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  47.24 
 
 
166 aa  150  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  48.78 
 
 
166 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.63 
 
 
167 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  48.17 
 
 
166 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  47.24 
 
 
167 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  47.56 
 
 
166 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  48.47 
 
 
166 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  48.45 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.56 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  49.69 
 
 
167 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  48.17 
 
 
166 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  49.07 
 
 
168 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  45.34 
 
 
165 aa  144  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  48.24 
 
 
168 aa  143  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  49.7 
 
 
172 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  45.73 
 
 
167 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  46.63 
 
 
173 aa  141  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.29 
 
 
165 aa  141  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  47.24 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  46.01 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  48.77 
 
 
164 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  42.68 
 
 
169 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.28 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  42.44 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.24 
 
 
165 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  42.86 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  43.64 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  41.57 
 
 
163 aa  130  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  40.48 
 
 
182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  45.4 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  41.57 
 
 
184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  43.48 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  43.48 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  42.35 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  44.1 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  41.61 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  41.14 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  42.94 
 
 
228 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  44.51 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  38.1 
 
 
182 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  40.36 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  36.09 
 
 
184 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  40.72 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  41.14 
 
 
178 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  40.11 
 
 
182 aa  103  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  39.41 
 
 
202 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.25 
 
 
177 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  40 
 
 
202 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  38.24 
 
 
202 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  37.02 
 
 
263 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.16 
 
 
178 aa  97.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.76 
 
 
179 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  41.86 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.42 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  43.18 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  42.31 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  40 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  35.67 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  43.85 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  41.67 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  42.42 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  41.67 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  41.67 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  41.67 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  37.72 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.42 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  41.09 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  35.29 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  38.04 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  37.8 
 
 
221 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>