More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0623 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  100 
 
 
452 aa  932    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1799  Phosphomannomutase  64.62 
 
 
456 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0102  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  54.73 
 
 
455 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  53.64 
 
 
455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0666  integral membrane protein  54.46 
 
 
455 aa  463  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0277597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0418  phosphomannomutase/phosphoglucomutase (PMM/PGM)  50.87 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1594  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  47.29 
 
 
456 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1406  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  47.38 
 
 
456 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1740  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  45.18 
 
 
456 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0256  phosphohexosemutase  46.67 
 
 
455 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.769457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  43.3 
 
 
456 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  43.3 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  43.08 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  43.31 
 
 
456 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  38.71 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  41.85 
 
 
447 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  40.17 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  40.48 
 
 
460 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  39.96 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  38.29 
 
 
462 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  39.39 
 
 
466 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  38.07 
 
 
462 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  41.63 
 
 
868 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  39.74 
 
 
463 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  37.64 
 
 
461 aa  315  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  38.29 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  39.74 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  40.53 
 
 
488 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  41.4 
 
 
854 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  38.62 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  39.26 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  38.07 
 
 
460 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  37.37 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  40.41 
 
 
465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  38.07 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  36.76 
 
 
461 aa  308  9e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  37.09 
 
 
464 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  38.83 
 
 
465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  38.22 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.74 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  38.77 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  39.82 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  37.42 
 
 
461 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  37.2 
 
 
486 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  38.39 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  40.86 
 
 
462 aa  306  7e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  36.88 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  38.21 
 
 
782 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  37.26 
 
 
475 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  39.35 
 
 
863 aa  302  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  37.14 
 
 
458 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  39.77 
 
 
462 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  36.84 
 
 
469 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  36.44 
 
 
464 aa  300  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  38.51 
 
 
462 aa  300  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  37.42 
 
 
460 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  39.46 
 
 
460 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  38.29 
 
 
462 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  39.32 
 
 
472 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  35.73 
 
 
457 aa  297  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  39.28 
 
 
881 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  38.86 
 
 
463 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  38.91 
 
 
469 aa  293  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  39.33 
 
 
467 aa  292  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  36.66 
 
 
464 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.1 
 
 
464 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.67 
 
 
472 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.67 
 
 
472 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  38.04 
 
 
450 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.67 
 
 
472 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.67 
 
 
464 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  38.74 
 
 
449 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.67 
 
 
464 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.67 
 
 
464 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  37.23 
 
 
464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  36.5 
 
 
464 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  36.5 
 
 
489 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  36.5 
 
 
489 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  36.01 
 
 
464 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  36.01 
 
 
487 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  37.72 
 
 
782 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  35.82 
 
 
457 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.62 
 
 
961 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  37.69 
 
 
469 aa  286  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  37.1 
 
 
466 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  36.46 
 
 
453 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  35.71 
 
 
471 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  38.21 
 
 
453 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  35.71 
 
 
471 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  38.78 
 
 
458 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  34.75 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  38.04 
 
 
830 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  35.14 
 
 
467 aa  272  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  34.93 
 
 
457 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  36.05 
 
 
462 aa  272  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  37.3 
 
 
455 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  38 
 
 
472 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  36.77 
 
 
474 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  37.42 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  35.43 
 
 
464 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>