More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0521 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.5  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.5  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  70.5  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  75 
 
 		 51 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  66.6  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 53 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  75 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 51 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 49 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 49 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 48 aa  62.8  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 47 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  72.73 
 
 		 52 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  76.74 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 52 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 50 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 52 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 46 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 46 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  73.81 
 
 		 45 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 45 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>