226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0477 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  49.5 
 
 
699 aa  718    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  50.72 
 
 
705 aa  730    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  50.29 
 
 
704 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  49.79 
 
 
727 aa  734    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  48.22 
 
 
709 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  100 
 
 
701 aa  1451    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  49.15 
 
 
702 aa  721    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  51.72 
 
 
726 aa  744    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  50.14 
 
 
704 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  51 
 
 
700 aa  713    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  49.15 
 
 
702 aa  721    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  50 
 
 
699 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  49.64 
 
 
699 aa  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  50.29 
 
 
704 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  49.2 
 
 
701 aa  720    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  49.93 
 
 
699 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  47.11 
 
 
696 aa  659    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  49.44 
 
 
709 aa  711    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  48.91 
 
 
701 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  48.42 
 
 
716 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  51.01 
 
 
702 aa  762    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  50.29 
 
 
704 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  43.45 
 
 
722 aa  611  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  40.85 
 
 
703 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  42.17 
 
 
747 aa  572  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  48.09 
 
 
553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  34.82 
 
 
933 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  38.07 
 
 
449 aa  317  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  38.27 
 
 
455 aa  311  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  46.09 
 
 
252 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  44.53 
 
 
252 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  26.71 
 
 
439 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  26.36 
 
 
430 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  26.04 
 
 
447 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 
1020 aa  143  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
280 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  25.11 
 
 
766 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  24.89 
 
 
412 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  25.24 
 
 
424 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  23.82 
 
 
417 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  24.03 
 
 
446 aa  93.6  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  25.43 
 
 
416 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  25 
 
 
447 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 
416 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  22.84 
 
 
430 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  25.29 
 
 
439 aa  91.3  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  25.57 
 
 
442 aa  91.3  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  24.93 
 
 
433 aa  91.3  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  22.52 
 
 
432 aa  90.5  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  23.82 
 
 
436 aa  90.1  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  24.68 
 
 
446 aa  90.1  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  25.17 
 
 
468 aa  89.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  26.2 
 
 
444 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  23.7 
 
 
425 aa  88.6  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  25.87 
 
 
487 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  23.54 
 
 
442 aa  87.8  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  24.84 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  25 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  23.89 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  23.89 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  23.89 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  27.4 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  22.68 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  23.24 
 
 
437 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
326 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  23.61 
 
 
455 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  23.19 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  22.64 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  25.75 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  25.32 
 
 
446 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  24.23 
 
 
423 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  23.03 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  24.44 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  25.86 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  24.51 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  25.68 
 
 
819 aa  77.8  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  21.53 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  26.47 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  22.06 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  31.07 
 
 
313 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  22.38 
 
 
434 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  22.16 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  30.62 
 
 
322 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  24.14 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  24.71 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  22.06 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  22.25 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  24.37 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  23.51 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  27.24 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  30.82 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  22.83 
 
 
417 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  23.78 
 
 
374 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  21.8 
 
 
429 aa  73.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  22.88 
 
 
425 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  26.27 
 
 
386 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  24.44 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  21.55 
 
 
437 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  20.6 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>