201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0429 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
104 aa  194  4e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  3.98633e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  77.88 
 
 
100 aa  152  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  79.41 
 
 
107 aa  131  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  70.19 
 
 
100 aa  125  2e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  81.18 
 
 
112 aa  115  2e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  81.18 
 
 
112 aa  115  2e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  81.18 
 
 
112 aa  115  2e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  74.04 
 
 
100 aa  110  7e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  73.08 
 
 
100 aa  110  8e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  52.78 
 
 
91 aa  77.8  5e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4416e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  52.78 
 
 
91 aa  77.8  5e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  51.39 
 
 
91 aa  75.5  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.50029e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  54.41 
 
 
91 aa  75.5  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
91 aa  75.1  3e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
91 aa  75.1  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.92065e-05  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  47.3 
 
 
88 aa  74.7  4e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  62.34 
 
 
93 aa  74.3  5e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
91 aa  73.9  7e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  50.67 
 
 
91 aa  72.8  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  45.21 
 
 
88 aa  72.4  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.29893e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  37.25 
 
 
111 aa  65.1  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  43.42 
 
 
82 aa  64.3  5e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  43.42 
 
 
82 aa  64.3  5e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
122 aa  63.5  8e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  41.33 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  41.33 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  41.33 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  41.33 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
109 aa  62.8  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
96 aa  62  3e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  42.5 
 
 
83 aa  60.5  8e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  1.10269e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  47.22 
 
 
107 aa  60.5  8e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  41.46 
 
 
86 aa  59.7  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
109 aa  59.3  2e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
93 aa  59.3  2e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 
92 aa  58.2  4e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  50.7 
 
 
107 aa  58.2  4e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  54.24 
 
 
106 aa  58.2  4e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.84566e-06  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  39.24 
 
 
95 aa  57.8  5e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  2.2409e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 
93 aa  57.4  6e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  40.26 
 
 
82 aa  57.4  6e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  36.11 
 
 
95 aa  57.4  7e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  51.85 
 
 
90 aa  56.2  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  33.78 
 
 
93 aa  55.1  3e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  38.75 
 
 
84 aa  55.5  3e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  38.75 
 
 
84 aa  55.5  3e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.13686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  39.24 
 
 
82 aa  55.1  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  38.75 
 
 
85 aa  55.5  3e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  49.18 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
93 aa  55.1  4e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 
93 aa  54.3  5e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  41.77 
 
 
100 aa  53.9  7e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  41.77 
 
 
100 aa  53.9  7e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  53.9  7e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
93 aa  53.5  8e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 
79 aa  53.5  9e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  35.62 
 
 
93 aa  53.5  9e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  36.99 
 
 
94 aa  53.5  9e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  42.37 
 
 
81 aa  52.8  1e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
76 aa  53.1  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
76 aa  53.1  1e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.4  2e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  41.56 
 
 
94 aa  52.8  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.56588e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.62288e-05  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  38.27 
 
 
82 aa  52.8  2e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  5.0881e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.84 
 
 
85 aa  52.4  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  40.68 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 
72 aa  52.8  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  54.72 
 
 
96 aa  52.8  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  38.27 
 
 
82 aa  52.8  2e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.4823e-07  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 
78 aa  52.8  2e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  42.37 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0972  ATP synthase F0, C subunit  56.1 
 
 
114 aa  52  3e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.68709e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  37.18 
 
 
81 aa  51.6  3e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  38.36 
 
 
88 aa  51.6  4e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
76 aa  51.6  4e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  39.34 
 
 
82 aa  51.2  4e-06  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  38.98 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  1.40393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  38.98 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  38.98 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  36.25 
 
 
85 aa  51.2  5e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.28569e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  42.11 
 
 
82 aa  50.8  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
75 aa  50.8  6e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  42.62 
 
 
91 aa  50.4  7e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
85 aa  50.8  7e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.05757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  43.64 
 
 
81 aa  50.4  8e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  34.38 
 
 
93 aa  50.4  8e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  38.98 
 
 
81 aa  50.4  8e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  37.93 
 
 
91 aa  50.1  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  35.37 
 
 
84 aa  50.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  35.37 
 
 
84 aa  50.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>