More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0377 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 661 aa  1357    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 696 aa  327  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 668 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 685 aa  277  4e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  28.69 
 
 		 699 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 673 aa  249  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 702 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 702 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 702 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 672 aa  160  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  24.43 
 
 		 723 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.52 
 
 		 676 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  23.91 
 
 		 688 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  24.1 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.36 
 
 		 676 aa  145  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  24.69 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.53 
 
 		 688 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  23.59 
 
 		 726 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  23.97 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  24.01 
 
 		 710 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  22.83 
 
 		 687 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  22.69 
 
 		 709 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 697 aa  136  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  22.45 
 
 		 724 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  22.43 
 
 		 745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  24.21 
 
 		 662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  22.43 
 
 		 745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  22.43 
 
 		 745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  22.3 
 
 		 749 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.79 
 
 		 661 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  22.38 
 
 		 710 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.03 
 
 		 710 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.03 
 
 		 710 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.03 
 
 		 710 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 684 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  22.29 
 
 		 749 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  22.29 
 
 		 745 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  22.29 
 
 		 753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  22.25 
 
 		 725 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  22.48 
 
 		 698 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  24.84 
 
 		 686 aa  127  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  24.84 
 
 		 681 aa  127  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 668 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.3 
 
 		 686 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  24.69 
 
 		 681 aa  125  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  23.47 
 
 		 667 aa  124  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  22.64 
 
 		 669 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  24.22 
 
 		 668 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  21.81 
 
 		 713 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 768 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 760 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  24.61 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  20.88 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  23.03 
 
 		 684 aa  119  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  24.06 
 
 		 668 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 681 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  22.89 
 
 		 695 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.07 
 
 		 665 aa  112  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  23.13 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 793 aa  106  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  20.36 
 
 		 691 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  21.66 
 
 		 772 aa  97.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.82 
 
 		 775 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 718 aa  88.2  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 705 aa  87.4  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 685 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 699 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 729 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 749 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 766 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  20.81 
 
 		 714 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 708 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 713 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 713 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 767 aa  72  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  29.33 
 
 		 708 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 664 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  21.53 
 
 		 701 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 713 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 697 aa  68.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 709 aa  68.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 735 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.62 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  20.63 
 
 		 716 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.73 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  22.12 
 
 		 698 aa  65.1  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 727 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.94 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  21.21 
 
 		 753 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>