More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0356 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  240  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  240  6e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  236  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1832  ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000136289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  61.69 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 158 aa  207  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 155 aa  207  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 155 aa  207  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  63.64 
 
 		 155 aa  206  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 157 aa  203  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  202  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  60.54 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>