179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0346 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0346  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000111455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0833  50S ribosomal protein L33P  54 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169832  normal  0.0907475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1542  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  normal  0.759054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 50 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 50 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2349  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0078385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  55.1 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  44.9 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  53.06 
 
 		 49 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  48.98 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2428  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000103029  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  45.83 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  54 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  54 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  52 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0612  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1054  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.185185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  52 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  52 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf336  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0709942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0666  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0094  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000258554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0094  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0094  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 48 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000015203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  44 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  44 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0089  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 48 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121403  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 54 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  38.78 
 
 		 55 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1484  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000298588  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl089  50S ribosomal protein L33  48.84 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0672  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000072872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  38.78 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0850  50S ribosomal protein L33  48 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0095  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000218198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  38.78 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>