More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0326 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  81.73 
 
 		 208 aa  353  6.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  82.69 
 
 		 208 aa  353  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  81.25 
 
 		 208 aa  350  7e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  80.29 
 
 		 208 aa  348  3e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  80.77 
 
 		 208 aa  347  7e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  79.33 
 
 		 208 aa  347  9e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  80.77 
 
 		 208 aa  347  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  80.77 
 
 		 208 aa  347  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  78.85 
 
 		 208 aa  338  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  54.29 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  54.29 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.18 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  54.29 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 200 aa  207  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 200 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  50.96 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 203 aa  204  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 200 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 200 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  53.81 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0834  ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  52.15 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>