More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0324 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  84.17 
 
 		 122 aa  206  9e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  84.03 
 
 		 121 aa  205  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  82.5 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  83.19 
 
 		 121 aa  203  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  82.35 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  82.35 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  81.67 
 
 		 122 aa  201  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  78.99 
 
 		 122 aa  195  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  79.83 
 
 		 127 aa  194  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 122 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.56 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  58.82 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  61.34 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 122 aa  147  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.02 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  57.98 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.02 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  58.82 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  56.3 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  56.52 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 123 aa  143  9e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  57.98 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  56.3 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  56.78 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  54.62 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  56.78 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  56.52 
 
 		 122 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  55.46 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  55.46 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  54.24 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  55.08 
 
 		 122 aa  137  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  61.95 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  54.7 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  53.85 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  55.08 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  54.7 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  61.06 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  52.99 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0395  30S ribosomal protein S13  55.46 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0403  30S ribosomal protein S13  55.46 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  53.85 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  51.69 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  55.56 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  53.39 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  54.7 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  54.24 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  54.24 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  54.24 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  56.36 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>