More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0302 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0302  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 118 aa  236  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.488983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1859  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1688  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.949463  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2065  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 118 aa  137  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1952  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0100  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1017  50S ribosomal protein L18  63.56 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000395061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1760  50S ribosomal protein L18  63.56 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00341283  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0050  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.341657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  46.79 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  45.69 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  47.27 
 
 		 116 aa  93.6  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  45.53 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  40.98 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  45.05 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  43.8 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  43.24 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  42.5 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  41.53 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  42.98 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  41.67 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  42.15 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  42.15 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf425  ribosomal protein L18  45.95 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  45.61 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  45.56 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  42.98 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  41.88 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  39.13 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  41.74 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  41.38 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  40.87 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  38.14 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  40.32 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  40.17 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  41.67 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  39.34 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  43.93 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  40.5 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  46.15 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  43.75 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  41.18 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  41.74 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  40.35 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  41.82 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  41.88 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  41.96 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  40.18 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  42.86 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  47.57 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  42.98 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  39.29 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  39.29 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  37.61 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  36.94 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  38.39 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  44.54 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  44.23 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  37.1 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  40.18 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  41.74 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  38.94 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  40 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  40.57 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  38.53 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  39.09 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  36.13 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  42.72 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  41.07 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  42.72 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  44.55 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  36.04 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  42.72 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  39.09 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  39.29 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  39.29 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  43 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  39.09 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  40.74 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  43.64 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  40.18 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  40.5 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  41.28 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>