More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0300 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0300  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.110485  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  75.57 
 
 
131 aa  209  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  74.81 
 
 
131 aa  209  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  74.81 
 
 
131 aa  208  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  75.57 
 
 
131 aa  207  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0048  30S ribosomal protein S8  74.81 
 
 
131 aa  200  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.580266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1954  ribosomal protein S8  72.52 
 
 
131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1763  30S ribosomal protein S8  69.47 
 
 
131 aa  189  8e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00017341  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  67.94 
 
 
131 aa  185  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1019  30S ribosomal protein S8  68.42 
 
 
114 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000503612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  47.66 
 
 
132 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  46.56 
 
 
131 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  48.85 
 
 
134 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  46.15 
 
 
134 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  45.04 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  49.62 
 
 
132 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
132 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
132 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
133 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
131 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  41.54 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  42.31 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  44.27 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1840  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
133 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
131 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
126 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
131 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
129 aa  107  5e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
131 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  41.54 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0351  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0440  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106924  hitchhiker  0.0000987465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
131 aa  105  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  43.08 
 
 
132 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
131 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  40.77 
 
 
131 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  45.74 
 
 
130 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
130 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  39.23 
 
 
132 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  40.46 
 
 
132 aa  104  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  43.08 
 
 
130 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
130 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
130 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
189 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
129 aa  104  4e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
131 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>