More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0298 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0046  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.772489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  64.44 
 
 		 181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1863  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 181 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1692  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 181 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0046073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 181 aa  238  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 181 aa  237  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 		 180 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5775  ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0133386  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  49.15 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  48.88 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  51.43 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 180 aa  194  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  51.38 
 
 		 181 aa  193  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  50 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  49.72 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 183 aa  191  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  51.12 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  49.14 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0091  50S ribosomal protein L5  52.44 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0564705 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  51.69 
 
 		 180 aa  191  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  49.15 
 
 		 187 aa  190  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  50 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  49.15 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  48.07 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  48.6 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  50 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  49.72 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  48.31 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  48.04 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  49.14 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  48.59 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1753  50S ribosomal protein L5  52.44 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 198 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  47.49 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  47.49 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>