More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0296 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0296  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2071  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  214  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1865  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  214  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1694  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  214  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00501261  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  213  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  213  5.9999999999999996e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  205  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  202  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0094  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  202  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.840193  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1767  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  201  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  176  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  176  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  176  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  174  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  174  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  173  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  173  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  172  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000152451  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000117206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000810078  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0611  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00801409  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  170  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  170  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  170  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  170  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0060  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  170  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000171332  hitchhiker  1.54022e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  169  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  67.21 
 
 
122 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>